Zabawa w SUPERHOT odbywa się w trzech głównych trybach – kampanii dla jednego gracza, Endless Mode oraz Wyzwań. W pierwszym przypadku rozgrywka podzielona jest na poszczególne misje, w drugim odpieramy kolejne fale nacierających przeciwników w paru nowych poziomach. Tryb wyzwań polega na ponownym przejściu kampanii, tym razem z różnymi modyfikacjami, np. za pomocą miecza, bez żadnej broni lub tylko z jednym życiem.